Der 16-jährige Setsuna staunt nicht schlecht, als eines Tages sowohl Engel als auch Dämonen bei ihm vorstellig werden und ihm offenbaren, dass in ihm die Seele des weiblichen Engels Alexiel ruht, der  einst mit Hilfe der Legionen der Hölle Gott stürzen wollte. Nun wollen beide Seiten den Geist von Alexiel wieder zum Leben erwecken - und Setsuna dafür aus dem Weg räumen. Doch der Junge hat noch ein ganz anderes Problem, er ist unsterblich in seine Schwester verliebt...

Angel Sanctuary stammt aus der Feder von Mangaka Kaori Yuki (u.a. Alice in Murderland), die ihre Geschichte erstmals im Jahre 1994 als Manga veröffentlichte. Die dreiteilige OVA entstand im Jahre 2000 und wurde von Regisseur Kiyoko Sayama (u.a. Vampire Knight) für das Studio Hal Film Maker adaptiert.